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OMICS Analysis
Metagenome Analysis
Metagenome community analysis는 미생물의 배양 없이 채취한 환경샘플에서 전체 DNA를 추출하고,
NGS 기술을 이용하여 유전정보를 획득하는 방법으로 커뮤니티 분석을 통해 미생물에 대한 이해를 높이고
풍부한 유전자원을 효율적으로 활용할 수
있는 방법으로 각광 받게 되었습니다.
Metagenome Analysis
Metagenome community analysis 란?
- 미생물들은 다양한 환경조건에서 군집을 이루며 동종 간 또는 이종 간에 상호작용을 통해 살아가기 때문에 배양이 불가능한 미생물과 더불어 단일 개체가 아닌 군집 수준의 미생물에 대한 연구와 같은 거시적인 관점에서의 연구가 미생물에 대한 올바를 이해와 활용을 위해 필요합니다.
- Metagenome community analysis는 미생물의 배양 없이 채취한 환경샘플에서 전체 DNA를 추출하고, NGS 기술을 이용하여 유전정보를 획득하는 방법으로 커뮤니티 분석을 통해 미생물에 대한 이해를 높이고 풍부한 유전자원을 효율적으로 활용할 수 있는 방법으로 각광받게 되었습니다.
A. 미생물 군집 dna 추출과정 / B. 미생물 군집 dna 차세대 염기서열 분석과정 / C. 군집 생물통계 분석
Metagenome community analysis의 특징
- 배양이 불가능한 미생물 분석이 가능하며, 새로운 생물 정보를 획득할 수 있고, 군집 내 커뮤니티 분석이 가능하다는 강점을 가집니다.
- 질병관련 미생물 군집 분석 및 유전자 분리 및 기능 규명이 가능하며, 샘플 내 viral community, 인간의 장내 미생물 군집, 신규 미생물과 고세균 등의 분리 및 분류 등에 적용 가능합니다.
Metagenome community analysis 결과 예시
품질검정
군집 도식화
Shotgun Metagenome Sequencing란?
- Metagenome assembly는 미생물 배양없이 획득한 커뮤니티 내 각각의 population 또는 isolate에 대한 분석입니다.
- Whole genome sequencing, de novo assembly 등을 통해 유전 정보를 분석합니다.
- 미생물에 대한 이해를 높이고 풍부한 유전자원을 효율적으로 활용할 수 있는 방법으로 각광받고 있습니다.
A. 미생물 군집 dna 추출과정 / B. 미생물 군집 dna 차세대 염기서열 분석과정 / C. 군집 생물통계 분석
Shotgun Metagenome Sequencing의 특징
품질검정
Contig 품질 검정
Contig 동정 및 gene annotation
군집 도식화
Meta transcriptome analysis란?
- Meta transcriptome analysis는 샘플에서 얻은 군집 내에서 발현되는 유전자와 특정 처리에 따른 유전자 발현 차이를 분석하는 방법으로 전사조절기작과 조절 네트워크에 대한 이해를 통해 다양한 환경의 미생물에 대한 유용 유전자 및 질병 치료, 생태 환경 개선에 효율적으로 활용할 수 있습니다.
- 이를 통해 미생물에 대한 이해를 높이고 풍부한 유전자원을 효율적으로 활용할 수 있는 방법으로 각광받게 되었습니다.
A. 미생물 군집 DNA 추출과정 / B. 미생물 군집 DNA 차세대 염기서열 분석과정 / C. 군집 생물통계 분석
Meta transcriptome analysis의 특징
- 배양이 불가능한 미생물 분석이 가능하며, 유용 유전자를 확보하거나 질병 및 생태환경에 대한 개선에 강점을 가집니다.
- 다양한 환경 내 미생물들의 전자조절기작을 통한 유전자 발현 연구, 농업 미생물의 전사조절 네트워크 분석을 통한 생산성, 질병저항성관련 유용 유전자 확보, 환경 내 미생물들의 전자조절기작 연구를 통한 환경 및 생태 개선 등에 적용 가능합니다.
Meta transcriptome analysis 결과 예시
- 배양이 불가능한 미생물 분석이 가능하며, 유용 유전자를 확보하거나 질병 및 생태환경에 대한 개선에 강점을 가집니다.
- 다양한 환경 내 미생물들의 전자조절기작을 통한 유전자 발현 연구, 농업 미생물의 전사조절 네트워크 분석을 통한 생산성, 질병저항성관련 유용 유전자 확보, 환경 내 미생물들의 전자조절기작 연구를 통한 환경 및 생태 개선 등에 적용 가능합니다.
Enriched functional categories
phylogenetic tree of coding sequences