사업분야
마이크로바이옴의 올바른 해석을 통한 건강한 세상 만들기, 이지놈이 시작합니다.
OMICS Analysis
Transcriptome analysis
Whole transcriptome analysis는 샘플의 RNA 컨텐츠에 대한 정보를 얻기 위한 목적으로 사용되는
CDNA의
염기 서열에 대한 high-throughput sequencing 기술을 의미하며,
암과 같은 질병 연구에 적용되어 왔습니다
Transcriptome analysis 란?
- Transcriptome 분석은 차세대 염기서열분석방법을 통해 생산한 RNA read 정보를 분석하여 샘플에 존재하는
RNA의 종류 및 양을 확인하는 방법입니다. - RNA sequencing 기술은 전체 transcriptome을 타겟으로 하여 unbiased한 기술입니다.
- 이러한 분석 방법은 특정 그룹 간의 발현 차이를 확인하기 위해 널리 사용되고 있으며, 그 외에도 alternative splicing event 및 새로운 transcript 등을 찾을 수 있습니다.
- 참조 유전체 서열의 존재 여부와 Sequencing Platform에 따라 분석방법이 달라질 수 있습니다.
Enrichment analysis
- 유전자 발현 차이 분석 후 가장 큰 문제는 찾은 수 백, 수 천개의 발현 차이 유전자를 어떻게 분석하고 해석할지 입니다.
- Enrichment 분석은 이러한 문제를 해결하기 위해 일반적으로 사용되는 방법으로 커다란 유전자 리스트를 작고 해석하기 쉬운 biological process, network 혹은 pathway 리스트로 요약해줍니다.
Functional enrichment 분석 예시
Protein Interaction 분석 예시
Transcriptome analysis 결과 예시
Heatmap of gene expression level
Multidimensional scaling
DEG analysis